禁教下で信仰を密かに継承した人々の歴史を伝える遺産群である。
仏教や神道を装いながら信仰を守り続けた集落が含まれる。
大浦天主堂での信徒発見は世界的な出来事とされる。
離島や山間部に残る潜伏の集落が構成資産となっている。

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