| 登録年 | 遺産名 | 区分 |
|---|---|---|
| 1993年 | 屋久島 | 自然遺産 |
| 1993年 | 白神山地 | 自然遺産 |
| 1993年 | 姫路城 | 文化遺産 |
| 1993年 | 法隆寺地域の仏教建造物 | 文化遺産 |
| 1994年 | 古都京都の文化財［京都市、宇治市、大津市］ | 文化遺産 |
| 1995年 | 白川郷・五箇山の合掌造り集落 | 文化遺産 |
| 1996年 | 厳島神社 | 文化遺産 |
| 1996年 | 広島平和記念碑［原爆ドーム］ | 文化遺産 |
| 1998年 | 古都奈良の文化財 | 文化遺産 |
| 1999年 | 日光の社寺 | 文化遺産 |
| 2000年 | 琉球王国のグスク及び関連遺産群 | 文化遺産 |
| 2004年 | 紀伊山地の霊場と参詣道 | 文化遺産 |
| 2005年 | 知床 | 自然遺産 |
| 2007年 | 石見銀山遺跡とその文化的景観 | 文化遺産 |
| 2011年 | 小笠原諸島 | 自然遺産 |
| 2011年 | 平泉‐仏国土［浄土］を表す建築・庭園及び考古学的遺跡群 | 文化遺産 |
| 2013年 | 富士山－信仰の対象と芸術の源泉 | 文化遺産 |
| 2014年 | 富岡製糸場と絹産業遺産群 | 文化遺産 |
| 2015年 | 明治日本の産業革命遺産 製鉄・製鋼、造船、石炭産業 | 文化遺産 |
| 2016年 | ル・コルビュジエの建築作品 － 近代建築運動への顕著な貢献 | 文化遺産 |
| 2017年 | 「神宿る島」宗像・沖ノ島と関連遺産群 | 文化遺産 |
| 2018年 | 長崎と天草地方の潜伏キリシタン関連遺産 | 文化遺産 |
| 2019年 | 百舌鳥・古市古墳群 | 文化遺産 |
| 2020年 | 奄美大島、徳之島、沖縄島北部及び西表島 | 自然遺産 |
| 2021年 | 北海道・北東北の縄文遺跡群 | 文化遺産 |
| 2024年 | 佐渡島の金山 | 文化遺産 |
| 2026年 | 飛鳥・藤原の宮都 | 文化遺産 |